Mit Hilfe modernster 3D-Computertechnologie ist jeder Aligner so hergestellt, dass er sich exakt den Zähnen anpasst und diese Tag für Tag, Millimeter für Millimeter in die durch den individuellen Behandlungsplan vorgesehene Richtung bewegt. Wie bei herkömmlichen Zahnspangen bewegt der Aligner die Zähne durch den gezielten Einsatz von kontrolliertem Druck. In jeder Phase werden nur bestimmte Zähne bewegt. Diese Bewegungen werden im Behandlungsplan für jede einzelne Phase genau fest gelegt. Daraus resultiert das effiziente und schonende System der kontrollierten Druckausübung.
Die Behandlung mit Invisalign ist allerdings nur bei regelmäßigem Tragen der Aligner erfolgreich. Der Kieferorthopäde empfiehlt daher, die Schienen ca. 22 Stunden am Tag (d.h. außer beim Essen und bei der Zahnpflege) zu tragen. Da die Aligner die Zähne in exakt festgelegten Einzelschritten bewegen, müssen die Schienen unbedingt in der vom Kieferorthopäden vorgeschriebenen Reihenfolge getragen werden. In der Regel wird jeder einzelne Aligner nach einer jeweils ca. 14-tägigen Behandlungsphase durch einen neuen ersetzt.