Die Behandlung mit Invisalign ist wie mit jeder anderen Zahnspange nur bei regelmäßigem Tragen der Aligner erfolgreich. Der Kieferorthopäde empfiehlt daher, die Schienen ca. 22 Stunden am Tag (d.h. außer beim Essen und Trinken und bei der Zahnpflege) zu tragen. Da die Aligner die Zähne in exakt festgelegten Einzelschritten bewegen, müssen die Schienen unbedingt in der vom Kieferorthopäden vorgeschriebenen Reihenfolge getragen werden. In der Regel wird jeder einzelne Aligner nach einer jeweils ca. 14-tägigen Behandlungsphase durch einen neuen ersetzt.
Die gesamte Behandlungsdauer hängt von der jeweiligen Zahnfehlstellung ab. Einfachere Behandlungen wie die Korrektur von Frontzähnen dauern durchschnittlich ca. 3-9 Monate, umfangreichere Zahnfehlstellungen dagegen ca. 1-2 Jahre. Eine erste Einschätzung über die zu erwartende Behandlungsdauer kann der Kieferorthopäde erst nach einer ersten Untersuchung abgeben.